基因组所乐成开发RNA在线处置惩罚平台“wapRNA”并揭晓相关论文
近期，由兴发娱乐胡松年研究员、宋述慧副研究员和生物信息平台认真人赵文明等配合组织构建的RNA在线处置惩罚平台“wapRNA”乐成上线，相关论文在国际期刊《Bioinformatics》上揭晓 。
随着基因组测序手艺的飞速生长，越来越多的科学家想通过研究RNA分子（mRNA和miRNA）的表达转变来探索生物学问题、展现生命历程和相识疾病爆发等 。然而，由第二代测序手艺产出的海量数据具有更高的软硬件要求，好比大型盘算机、海量存储、专业的盘算机维护职员、顺应新数据要求的数据处置惩罚软件、专门的数据剖析职员等，这给古板的生物科学家带来了新的机缘和挑战 。
为相识决古板科学家在海量数据处置惩罚方面面临的问题，基因组所科研职员针对差别的第二代测序手艺（主要有SOLiD和Solexa）和差别的研究工具（mRNA和miRNA）开发了基于网站的RNA在线处置惩罚平台wapRNA 。该平台提供了一套完整的工具，可以使古板科学家通过在网站上简朴的选择来完成从RNA原始数据（rawdata）处置惩罚到获得最终效果等一系列数据处置惩罚历程,同时还提供了可供用户下载的每一步数据处置惩罚历程效果及统计图表信息 。别的，研发职员还集成了一些常用的功效剖析 ？，好比基因差别表达剖析（DEGseq）、代谢通路剖析（KEGG）、Gene Ontology 剖析（Go）和miRNA靶基因展望（Target prediction）等，以及可以在外地执行的程序包，可以让各人利便的在外地盘算机上装置使用 。
文章链接：http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/27/21/3076
网站链接：http://waprna.big.ac.cn
知识介绍：
RNA作为三个主要的生物大分子之一，是相识生物生长、发育、疾病等主要生命历程的要害物质 。RNA主要分为两类，一类是messenger RNA（mRNA），使用自身携带的遗传信息来指导卵白质的合成；另一类则是通过催化生物反应、控制基因表达、影响染色体结构等来实现自己的功效，这类RNA中研究较量深入和普遍的是microRNA（miRNA），它通过与mRNA相团结抑制或者降解靶mRNA来实现转录后调控 。
